Poiché il progetto tecnologico funziona, gli scienziati si convincono della buona fede degli interlocutori e cedono, imprudentemente, alla tentazione di sperimentare anche quello genetico. Da un ovulo umano fecondato con il DNA modificato nasce "Sil", una femmina all'apparenza normale ma il cui metabolismo di crescita incredibilmente accelerato è solo il primo indizio della sua profonda diversità.
Quando, nel crescente timore di aver dato vita ad un mostro, Xavier Fitch, responsabile dell'operazione, decide di sopprimerla, la bambina, dimostrando intuito e capacità sovrumane, fugge dal laboratorio e salta sul primo treno che passa. Durante il viaggio Sil subisce una straordinaria metamorfosi e giunge a Los Angeles ormai trasformata in un'affascinante ragazza, che un incontrollabile istinto riproduttivo alieno spinge alla ricerca di un partner con cui generare una stirpe di mutanti destinata, in breve tempo, a sostituire l'umanità. Per trovarla e fermarla, Fitch organizza una squadra composta dall'antropologo Dr. Stephen Arden, dalla biologa molecolare Dr. Laura Baker, dall'empatico Dan Smithson, in grado di percepirne la presenza, e da Preston Lennox, investigatore con licenza di uccidere. La caccia si snoda attraverso la scia di omicidi che la ragazza lascia dietro si sè, e si conclude nelle tortuose gallerie della rete fognaria dove Sil, ormai del tutto aliena anche nell'aspetto, si è rintanata per dare alla luce il mostruoso ibrido che ha procreato.
Nelle intenzioni del regista Donaldson il soggetto dovrebbe suggerire una metafora del moderno colonialismo, ma qualche commentatore vi ha letto anche un discorso sulla maternità negata, agganciando le peripezie della perseguitata madre aliena alle scenografie "uterine" dei vicoli e dei cunicoli bui. Senza soffermarci a ricercare referenze tematiche letterarie o a cogliere derivazioni stilistiche dal primo Alien, il film va forse più prudentemente considerato come un onesto lavoro di pura evasione che mette efficacemente a servizio della fantascienza gli stereotipi dell'horror e del thriller erotico.
Il film ha avuto due sequel: Species II (1997) e Species III (2004).
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